More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0950 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  66.67 
 
 		 488 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  70.14 
 
 		 488 aa  675    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 491 aa  986    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  61.55 
 
 		 489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  62.58 
 
 		 489 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  62.37 
 
 		 489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  58.1 
 
 		 533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  50.2 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  52.9 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  51.23 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  51.6 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  48.63 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  48.43 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  55.03 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  54.13 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  46.73 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  55.53 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  52.79 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  46.87 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  46.75 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  52.69 
 
 		 542 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  49.35 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  47.13 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  46.03 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  52.65 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  46.84 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  46.36 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  45.77 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  52.25 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  52.17 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  53.19 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  44.65 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  58.51 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  47.15 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  51.32 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  47.38 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  49.21 
 
 		 500 aa  359  5e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  47.13 
 
 		 500 aa  356  5e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  50.67 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  46.55 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  42.47 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  49.08 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  50.6 
 
 		 485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  51.05 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  51.76 
 
 		 508 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  44.87 
 
 		 503 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  44.03 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  44.12 
 
 		 503 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  44.12 
 
 		 503 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  44.12 
 
 		 503 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  53.89 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  53.89 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  53.89 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  53.89 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  42.6 
 
 		 493 aa  320  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  53.27 
 
 		 503 aa  320  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  45.04 
 
 		 497 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  48.72 
 
 		 536 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  44.06 
 
 		 503 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  47.33 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  47.98 
 
 		 536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  43.38 
 
 		 503 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  43.61 
 
 		 503 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  43.61 
 
 		 503 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  43.61 
 
 		 503 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  43.38 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  51.24 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  51.55 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  46.13 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  49.6 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  48.7 
 
 		 500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2918  leucyl aminopeptidase  50.14 
 
 		 507 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  53.55 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  47.55 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  45.19 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.07 
 
 		 510 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 496 aa  299  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  47.95 
 
 		 497 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  46.43 
 
 		 502 aa  299  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  51.86 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  51.86 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  45.8 
 
 		 510 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  45.8 
 
 		 510 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  45.8 
 
 		 510 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  46.15 
 
 		 502 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  45.88 
 
 		 502 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  47.11 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  45.88 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  38.88 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  46.69 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  45.88 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  45.88 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  42.22 
 
 		 495 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  46.69 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  40.09 
 
 		 511 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>