More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2389 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
556 aa  1102    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  43.75 
 
 
496 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  43.86 
 
 
500 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  46.12 
 
 
496 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  45.55 
 
 
487 aa  346  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  45.59 
 
 
499 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  45.04 
 
 
500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  43.52 
 
 
498 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  44.86 
 
 
500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  45.35 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  45.69 
 
 
497 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  45.45 
 
 
497 aa  334  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  48.53 
 
 
495 aa  334  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  42.77 
 
 
497 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  43.75 
 
 
497 aa  333  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 
498 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 
500 aa  331  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  43.7 
 
 
499 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  42.69 
 
 
500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  45.3 
 
 
503 aa  329  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  46.12 
 
 
497 aa  329  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  48.1 
 
 
539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 
500 aa  327  3e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  43.38 
 
 
500 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  39.55 
 
 
500 aa  326  6e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  40.7 
 
 
506 aa  326  8.000000000000001e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  47.64 
 
 
542 aa  323  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  47.59 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  43.18 
 
 
497 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  46.9 
 
 
489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  45.39 
 
 
481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
494 aa  319  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
497 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
497 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  47.99 
 
 
508 aa  316  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  47.37 
 
 
489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 
485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  44.32 
 
 
500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  42.62 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  43.36 
 
 
488 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  47.17 
 
 
489 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.47 
 
 
492 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  47.17 
 
 
489 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.99 
 
 
497 aa  299  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  44.64 
 
 
487 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  43.08 
 
 
514 aa  296  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  38.59 
 
 
511 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  38.59 
 
 
511 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  38.59 
 
 
511 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  44.05 
 
 
488 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  45.95 
 
 
482 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  39.24 
 
 
510 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 
518 aa  290  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 
510 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 
510 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 
510 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 
511 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  41.96 
 
 
492 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  38.18 
 
 
511 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  39.82 
 
 
496 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
522 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  44.68 
 
 
495 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  44.8 
 
 
501 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  40.53 
 
 
474 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 
493 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  41.24 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  43.21 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  40 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  48.08 
 
 
500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  42.94 
 
 
496 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0053  leucyl aminopeptidase  37.15 
 
 
548 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 
503 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  43.25 
 
 
491 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  39.11 
 
 
493 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  38.73 
 
 
496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  39.07 
 
 
496 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0043  PepA aminopeptidase  34.36 
 
 
552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.727266  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  39.32 
 
 
510 aa  270  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  39.63 
 
 
503 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  42.74 
 
 
500 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2173  leucyl aminopeptidase  45.87 
 
 
469 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  47.64 
 
 
496 aa  267  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  41.94 
 
 
480 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
495 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 
496 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
521 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 
496 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  43.17 
 
 
496 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  43.36 
 
 
515 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  41.89 
 
 
493 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  41.83 
 
 
497 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>