More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2744 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  74.76 
 
 
427 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  74.53 
 
 
427 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  74.53 
 
 
427 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  76.8 
 
 
432 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  74.76 
 
 
427 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  75.18 
 
 
428 aa  680    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  81.65 
 
 
436 aa  746    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  77.03 
 
 
432 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  100 
 
 
431 aa  890    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  74.76 
 
 
427 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  74.76 
 
 
427 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  74.53 
 
 
427 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  74.76 
 
 
427 aa  670    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  76.8 
 
 
432 aa  666    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  74.53 
 
 
427 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  75 
 
 
427 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  74.76 
 
 
427 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  74.53 
 
 
427 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  82.34 
 
 
436 aa  727    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  88.14 
 
 
431 aa  792    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  77.67 
 
 
431 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  74.53 
 
 
427 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  74.76 
 
 
427 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  59.25 
 
 
432 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  58.37 
 
 
444 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  59.02 
 
 
432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  55.29 
 
 
428 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  53.94 
 
 
432 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  51.98 
 
 
430 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  48.94 
 
 
427 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  48.58 
 
 
427 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  48.71 
 
 
430 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  48.48 
 
 
430 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  48.48 
 
 
430 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  49.06 
 
 
425 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  48.24 
 
 
430 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  48.48 
 
 
430 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  48.48 
 
 
430 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  49.77 
 
 
427 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  47.78 
 
 
430 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  47.78 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  47.78 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  47.89 
 
 
425 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  48.71 
 
 
425 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  47.75 
 
 
424 aa  364  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  46.71 
 
 
425 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  47.65 
 
 
425 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.56 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  44.48 
 
 
488 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  42.47 
 
 
463 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  42.78 
 
 
616 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  43.08 
 
 
491 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  40.27 
 
 
508 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 
491 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  38.19 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  36.08 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 
503 aa  213  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.91 
 
 
482 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
501 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  42.68 
 
 
503 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.55 
 
 
510 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  39.61 
 
 
458 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  39.26 
 
 
496 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  39.58 
 
 
453 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  39.29 
 
 
458 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  43.04 
 
 
455 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  42.48 
 
 
492 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
467 aa  210  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 
496 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
510 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
510 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
510 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
511 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
511 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.32 
 
 
512 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 
490 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  40.95 
 
 
518 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
511 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  39.32 
 
 
483 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  40.81 
 
 
497 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  40.18 
 
 
506 aa  206  6e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 
536 aa  206  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 
528 aa  206  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
503 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
518 aa  206  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  39.32 
 
 
483 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 
485 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  42.63 
 
 
479 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  38.79 
 
 
465 aa  205  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  38.24 
 
 
453 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  40.81 
 
 
497 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 
507 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  40.92 
 
 
463 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  40.19 
 
 
497 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  40.5 
 
 
497 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
492 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  44.2 
 
 
460 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 
463 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>