More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3939 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  100 
 
 
427 aa  883    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  62.97 
 
 
427 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  57.92 
 
 
430 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  57.68 
 
 
425 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  57.68 
 
 
430 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  57.45 
 
 
430 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  57.68 
 
 
430 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  58.16 
 
 
430 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  57.58 
 
 
425 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  57.21 
 
 
430 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  57.92 
 
 
430 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  57.92 
 
 
430 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  57.45 
 
 
425 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  56.74 
 
 
425 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  56.97 
 
 
430 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  57.04 
 
 
424 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  56.97 
 
 
427 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  56.03 
 
 
425 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  52.58 
 
 
427 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  51.52 
 
 
432 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  52.58 
 
 
427 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  51.88 
 
 
427 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  50.12 
 
 
428 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  52.35 
 
 
427 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  51.64 
 
 
427 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  52.35 
 
 
427 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  51.41 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  51.41 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  51.41 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  51.41 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  52.11 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  51.41 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  51.41 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  51.41 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  51.41 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  50.94 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  49.65 
 
 
444 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  50.35 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  50 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  48.94 
 
 
431 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  52.8 
 
 
432 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  52.57 
 
 
432 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  52.57 
 
 
432 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  48.71 
 
 
431 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  49.65 
 
 
431 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  49.77 
 
 
436 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  44.21 
 
 
432 aa  355  8.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  38.61 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  38.44 
 
 
454 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 
524 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  37.35 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
510 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
510 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
510 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  37.7 
 
 
455 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  40.99 
 
 
512 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.39 
 
 
512 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
490 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.91 
 
 
487 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  38.23 
 
 
518 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39.08 
 
 
482 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  38.86 
 
 
478 aa  190  5e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  40.06 
 
 
511 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
488 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  35.73 
 
 
463 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
460 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  37.84 
 
 
508 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  35.6 
 
 
508 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  37.32 
 
 
506 aa  187  4e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  35.96 
 
 
476 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
491 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  40 
 
 
507 aa  186  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  37.28 
 
 
463 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  44.96 
 
 
616 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  42.37 
 
 
493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0809  Leucyl aminopeptidase  43.37 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  39.14 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  34.76 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  35.01 
 
 
462 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  34.75 
 
 
463 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  35.2 
 
 
461 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  35.33 
 
 
453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 
480 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  36.05 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  35.96 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  37.42 
 
 
502 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  37.5 
 
 
511 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
493 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  34.76 
 
 
465 aa  182  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  38.08 
 
 
491 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  45.95 
 
 
497 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  36.67 
 
 
482 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  37.66 
 
 
493 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  40.82 
 
 
499 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0942  leucyl aminopeptidase  37.46 
 
 
491 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000141976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0961  leucyl aminopeptidase  37.46 
 
 
491 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000756547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  38.15 
 
 
497 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>