More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1284 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  75.59 
 
 
427 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  75.82 
 
 
427 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  76.76 
 
 
427 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  75.59 
 
 
427 aa  672    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  76.53 
 
 
427 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  75.59 
 
 
427 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  75.35 
 
 
427 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  75.82 
 
 
427 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  80.05 
 
 
436 aa  717    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  76.76 
 
 
427 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  99.54 
 
 
432 aa  887    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  75.59 
 
 
427 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  100 
 
 
432 aa  890    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  83.99 
 
 
431 aa  743    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  79.82 
 
 
436 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  100 
 
 
432 aa  890    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  76.53 
 
 
427 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  76.76 
 
 
427 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  77.28 
 
 
428 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  76.8 
 
 
431 aa  699    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  75.59 
 
 
427 aa  672    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  80.23 
 
 
431 aa  711    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  75.59 
 
 
427 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  62.56 
 
 
444 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  60.74 
 
 
432 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  61.02 
 
 
432 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  57.41 
 
 
428 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  55.79 
 
 
432 aa  487  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  53.38 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  52.57 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  52.01 
 
 
427 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  49.41 
 
 
430 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  50 
 
 
425 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  49.18 
 
 
430 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  49.77 
 
 
425 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  50.82 
 
 
425 aa  363  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  49.06 
 
 
425 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  48.71 
 
 
430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  49.77 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  47.78 
 
 
430 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  50.47 
 
 
424 aa  360  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  47.42 
 
 
425 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  43.06 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  41.12 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  42.99 
 
 
487 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  42.2 
 
 
467 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  47.39 
 
 
481 aa  217  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  35.18 
 
 
454 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.37 
 
 
488 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  42.68 
 
 
455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  41.32 
 
 
493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  41.9 
 
 
616 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  41.32 
 
 
493 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  34.96 
 
 
454 aa  212  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  44.24 
 
 
460 aa  212  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  41.35 
 
 
458 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.57 
 
 
497 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  39.37 
 
 
483 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  39.37 
 
 
483 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  41.03 
 
 
458 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
490 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  40.88 
 
 
491 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  37.57 
 
 
453 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  40.22 
 
 
456 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 
503 aa  206  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  40 
 
 
492 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  38.28 
 
 
506 aa  204  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 
485 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
491 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  43.55 
 
 
460 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  40.95 
 
 
476 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.01 
 
 
512 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 
487 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  41.14 
 
 
503 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  34.62 
 
 
461 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
503 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  36.96 
 
 
453 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  41.43 
 
 
479 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  37.92 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  41.14 
 
 
463 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  36.27 
 
 
495 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.06 
 
 
518 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  41.02 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  40.07 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  41.36 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  40.4 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  39.32 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.88 
 
 
510 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  40.45 
 
 
528 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  38.18 
 
 
518 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
503 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  40.07 
 
 
465 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
508 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>