More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3796 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  76.42 
 
 		 430 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  76.89 
 
 		 430 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  76.18 
 
 		 430 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  78.77 
 
 		 425 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  76.65 
 
 		 430 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  76.42 
 
 		 430 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  79.53 
 
 		 425 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  74.41 
 
 		 425 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  100 
 
 		 425 aa  870    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  77.36 
 
 		 430 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  77.59 
 
 		 430 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  87.06 
 
 		 425 aa  748    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  77.59 
 
 		 430 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  75.29 
 
 		 427 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  76.65 
 
 		 430 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  72.81 
 
 		 424 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  57.88 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  56.74 
 
 		 427 aa  431  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  49.07 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  49.77 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  50.47 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  48.37 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  49.18 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  48.95 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  48.48 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  49.18 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  48.95 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  49.18 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  48.95 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  48.48 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  48.48 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  47.07 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  46.71 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  46.51 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  46.01 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  46.64 
 
 		 432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  46.51 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  45.67 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  47.54 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  47.54 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  47.54 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  41.19 
 
 		 524 aa  213  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.32 
 
 		 496 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  35.57 
 
 		 491 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  38.66 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  45.02 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  37.09 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  37.09 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  37.09 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  40.75 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  37.07 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  38.48 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 		 510 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  36.57 
 
 		 507 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  39.38 
 
 		 502 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  40.99 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  38.23 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  39.4 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 		 518 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  39.4 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  40.82 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  36.96 
 
 		 478 aa  186  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  38.7 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40.89 
 
 		 511 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40.89 
 
 		 511 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  38.87 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 505 aa  186  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  41.8 
 
 		 616 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  40.89 
 
 		 511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  39.33 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  34.54 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  38.87 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  39.03 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  40.34 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  43.61 
 
 		 497 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  41.25 
 
 		 460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  40.27 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  40.61 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  36.89 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  38.67 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 		 521 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  37.54 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>