More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1331 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  100 
 
 
430 aa  883    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  55.2 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  53.27 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  53.27 
 
 
432 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  54.5 
 
 
436 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  52.34 
 
 
428 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  52.58 
 
 
432 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  52.91 
 
 
444 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  51.63 
 
 
427 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  51.63 
 
 
427 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  51.63 
 
 
427 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  51.63 
 
 
427 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  51.98 
 
 
431 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  51.63 
 
 
427 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  51.63 
 
 
427 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  52.34 
 
 
431 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  51.63 
 
 
427 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  51.63 
 
 
427 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  51.86 
 
 
427 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  51.4 
 
 
427 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  51.4 
 
 
427 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  51.86 
 
 
427 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  51.86 
 
 
427 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  51.4 
 
 
427 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  52.45 
 
 
431 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  50.7 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  53.38 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  53.15 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  53.38 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  50.7 
 
 
427 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  51.52 
 
 
427 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  51.64 
 
 
424 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  51.16 
 
 
425 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  51.86 
 
 
427 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  51.04 
 
 
430 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  50.93 
 
 
430 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  50.93 
 
 
425 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  50.23 
 
 
425 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  50.93 
 
 
425 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  50.7 
 
 
430 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  50.7 
 
 
430 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  50 
 
 
430 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  49.77 
 
 
430 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  50 
 
 
430 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  49.77 
 
 
425 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  50 
 
 
430 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  49.77 
 
 
430 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
616 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.51 
 
 
496 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 
490 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 
507 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  38.82 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  46.95 
 
 
503 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  38.65 
 
 
491 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
463 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 
518 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  42.46 
 
 
505 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  40.07 
 
 
465 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  36.68 
 
 
476 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  39.75 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  36.71 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  36.41 
 
 
472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  36.71 
 
 
510 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  36.71 
 
 
510 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
463 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  36.71 
 
 
510 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  38.68 
 
 
463 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  39.22 
 
 
462 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  35.73 
 
 
511 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  35.73 
 
 
511 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.43 
 
 
497 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
461 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 
508 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
453 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 
501 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  35.73 
 
 
511 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
455 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  44.78 
 
 
503 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
507 aa  193  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 
496 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
512 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  38.58 
 
 
453 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  37.81 
 
 
454 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  38.11 
 
 
454 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  36.31 
 
 
460 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  44.03 
 
 
503 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  35.95 
 
 
458 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  39.69 
 
 
492 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  40 
 
 
491 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  35.65 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  39.01 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  39.58 
 
 
458 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  38.8 
 
 
460 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  36.21 
 
 
453 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
461 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  35.65 
 
 
453 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3836  leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 
575 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0130732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  40.19 
 
 
528 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  41.22 
 
 
460 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>