More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3897 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  87.06 
 
 		 425 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  78.07 
 
 		 430 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  100 
 
 		 425 aa  864    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  76.3 
 
 		 425 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  78.77 
 
 		 425 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  78.54 
 
 		 430 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  78.77 
 
 		 430 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  81.13 
 
 		 430 aa  687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  78.77 
 
 		 430 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  80.42 
 
 		 430 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  77.41 
 
 		 427 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  80.9 
 
 		 430 aa  688    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  80.66 
 
 		 430 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  80.9 
 
 		 430 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  78.82 
 
 		 425 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  74.64 
 
 		 424 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  58.59 
 
 		 427 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  57.45 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  52.33 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  51.75 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  51.64 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  51.52 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  51.52 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  50.93 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  51.52 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  51.52 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  51.28 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  51.52 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  51.28 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  51.28 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  51.16 
 
 		 430 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  50.12 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  51.28 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  51.05 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  51.28 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  51.28 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  51.05 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  49.41 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  49.06 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  48.83 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  47.8 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  48.83 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  48.12 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  48.95 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  50.12 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  50.12 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  50.12 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  42.06 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  39.32 
 
 		 496 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  39.22 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  33.58 
 
 		 493 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  38.82 
 
 		 493 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  38.2 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  42.17 
 
 		 511 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  38.25 
 
 		 482 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  32.24 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  38.2 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  37.99 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  38.6 
 
 		 502 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  38.77 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  38.77 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  40.18 
 
 		 515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 		 518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  35.91 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  44.18 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  39.05 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  36.97 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  38.7 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 		 510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 		 510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0837  Leucyl aminopeptidase  38.18 
 
 		 483 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.775484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  35.6 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  34.54 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  40.34 
 
 		 491 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  36 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  36 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  42.66 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  38.79 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  36.5 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  39.61 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  38.44 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  40.07 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  37.07 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  41.51 
 
 		 507 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 		 487 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  39.29 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  38.1 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  34.54 
 
 		 495 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  36.86 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  36.83 
 
 		 507 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>