More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03542 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  100 
 
 
427 aa  876    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  62.97 
 
 
427 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  59.48 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  58.73 
 
 
430 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  59.24 
 
 
430 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  59.34 
 
 
425 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  59.48 
 
 
430 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  57.88 
 
 
425 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  58.59 
 
 
427 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  58.59 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  56.54 
 
 
424 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  57.41 
 
 
425 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  50.12 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  51.76 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  50 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  50.35 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  50.12 
 
 
427 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  50.81 
 
 
432 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  51.29 
 
 
444 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  51.52 
 
 
432 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  50 
 
 
427 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  50 
 
 
427 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  50 
 
 
427 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  48.94 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  49.76 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  49.76 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  48.58 
 
 
431 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  50 
 
 
436 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  52.12 
 
 
432 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  52.12 
 
 
432 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  52.12 
 
 
432 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  49.18 
 
 
431 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  50.24 
 
 
431 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  49.07 
 
 
428 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  45.24 
 
 
432 aa  361  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  41.12 
 
 
512 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  42.59 
 
 
496 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  44.83 
 
 
497 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  44.86 
 
 
496 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.25 
 
 
518 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5066  leucyl aminopeptidase  40.19 
 
 
494 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 
510 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3532  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
493 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 
510 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 
510 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  41.34 
 
 
510 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 
497 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  43.79 
 
 
497 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  41.34 
 
 
511 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  41.34 
 
 
511 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5060  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
494 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4653  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
494 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  41.67 
 
 
511 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  43.49 
 
 
497 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  36.75 
 
 
500 aa  204  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4792  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
494 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4633  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
494 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5032  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
494 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5155  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
494 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  43.49 
 
 
497 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  39.35 
 
 
463 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  43.84 
 
 
512 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 
496 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40 
 
 
497 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  40.87 
 
 
496 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  35.43 
 
 
482 aa  203  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 
511 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 
502 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  38.62 
 
 
500 aa  202  7e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  38.73 
 
 
476 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  43.84 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  40.59 
 
 
489 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 
503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0181  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4743  leucyl aminopeptidase  39.69 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  42.04 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  41.41 
 
 
502 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  39.2 
 
 
503 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5057  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
494 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.708172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 
482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
487 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.38 
 
 
498 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  37.72 
 
 
500 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  40.49 
 
 
502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  38.92 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>