96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2374 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  842    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  37.84 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  38.24 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  39.02 
 
 		 416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  39.21 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  39.02 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  36.41 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  39.26 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  37.91 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  38.76 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  35.07 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  33.83 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  34.5 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  43.93 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  32.54 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  34.56 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  32.18 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  29.69 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  31.44 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  30.19 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28.64 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  38.78 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.17 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.13 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  32.72 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  31.22 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  30.19 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.45 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  33.11 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  26.32 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  31.35 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  28.29 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.79 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  30.26 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.46 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.46 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  29.28 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.35 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  26.13 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.19 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  29.8 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  32.33 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  31.85 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  28.57 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.86 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  31.65 
 
 		 230 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  28.89 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  29.08 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  30.87 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  31.29 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  29.25 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.25 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  25.99 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  28.57 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.73 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.73 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  23.03 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2933  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.7 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.277455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2617  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.57 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263723  hitchhiker  0.00106881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1368  carbon dioxide concentrating mechanism protein  39.51 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1328  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.4 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.999379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0271  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.22 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1861  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.932275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0068  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.72 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5279  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.1 
 
 		 451 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.307917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0560  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.68 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4068  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.45 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0178  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.45 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3958  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.67 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0007  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.78 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4101  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.5 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1542  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1625  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.73 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1246  nucleotidyl transferase  26.54 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300235  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  32.26 
 
 		 174 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1293  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.75 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1600  carbon dioxide concentrating mechanism protein  33.73 
 
 		 244 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  31.73 
 
 		 176 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  29.84 
 
 		 175 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.95 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488351  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3684  nucleotidyl transferase  26.05 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000826363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0014  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.87 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3644  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  19.63 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0588  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.13 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0288  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.05 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3642  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  30.88 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0848816  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4043  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.53 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.394972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0220  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.64 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18871  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.95 
 
 		 470 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  29.27 
 
 		 370 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>