17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1625 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1625  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1600  carbon dioxide concentrating mechanism protein  89.34 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1368  carbon dioxide concentrating mechanism protein  43.7 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1614  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmN  37.8 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4468  hexapaptide repeat-containing transferase  38.19 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3847  hexapaptide repeat-containing transferase  49.58 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1861  hexapaptide repeat-containing transferase  35.9 
 
 		 255 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.932275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1424  carbon dioxide concentrating mechanism protein  43.94 
 
 		 161 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0922842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  30.91 
 
 		 556 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  30.43 
 
 		 672 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  30.43 
 
 		 675 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  32.32 
 
 		 188 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  33.73 
 
 		 420 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  26.96 
 
 		 552 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  42.59 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4502  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  33.64 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  26.44 
 
 		 174 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>