24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1614 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1614  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmN  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1600  carbon dioxide concentrating mechanism protein  40.56 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1625  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.8 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1368  carbon dioxide concentrating mechanism protein  36.18 
 
 		 265 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4468  hexapaptide repeat-containing transferase  37.95 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3847  hexapaptide repeat-containing transferase  49.15 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1424  carbon dioxide concentrating mechanism protein  50.89 
 
 		 161 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0922842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1861  hexapaptide repeat-containing transferase  33.77 
 
 		 255 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.932275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  27.83 
 
 		 672 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  29.53 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  28.7 
 
 		 675 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  28.83 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  25.88 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  27.35 
 
 		 552 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  28.21 
 
 		 556 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  26.42 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.7 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  29.17 
 
 		 171 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4486  hexapaptide repeat-containing transferase  29.66 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932565  normal  0.437237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  26.96 
 
 		 666 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  37.65 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  28.46 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  26.96 
 
 		 666 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  29.27 
 
 		 173 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>