97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2717 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  87.75 
 
 
457 aa  802    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  923    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  58.02 
 
 
413 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  35.78 
 
 
431 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  34.72 
 
 
398 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  34.19 
 
 
397 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  32.32 
 
 
390 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  33.87 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 
389 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  33.03 
 
 
415 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  33.73 
 
 
415 aa  190  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  32.57 
 
 
416 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  30.73 
 
 
391 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  30.68 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  31.78 
 
 
417 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  29.51 
 
 
391 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  29.98 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  31.75 
 
 
420 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  29.52 
 
 
389 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  27.73 
 
 
377 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  31.79 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  32.73 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  32.97 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  31.72 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  34.31 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  32.59 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.81 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  28.48 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.35 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  31.41 
 
 
393 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.86 
 
 
400 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  30.66 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
400 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  25.85 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  29.37 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.23 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.27 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.37 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1802  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.4 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.13 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.57 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.907512  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0560  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.54 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.4 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  28.21 
 
 
218 aa  54.7  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.6 
 
 
452 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0007  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.17 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  28.8 
 
 
403 aa  53.9  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2805  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.45 
 
 
455 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.801762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3201  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.45 
 
 
455 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  26.92 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.54 
 
 
411 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2617  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.46 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263723  hitchhiker  0.00106881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  31.62 
 
 
209 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.86 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.86 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.41 
 
 
458 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488351  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.06 
 
 
411 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.11 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  28.12 
 
 
212 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3546  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.91 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.837233  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0098  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.08 
 
 
469 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.46 
 
 
224 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0229  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  30.22 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.976567  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  26.43 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2855  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.17 
 
 
452 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5279  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.08 
 
 
451 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.307917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  23.91 
 
 
411 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0557  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.08 
 
 
460 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0220  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.54 
 
 
452 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600609  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  31.68 
 
 
363 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.91 
 
 
414 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.89 
 
 
453 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0186  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.67 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  24.57 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0288  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.87 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0068  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.66 
 
 
466 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0533  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.77 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0453814  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2933  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.74 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.277455  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0133  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.57 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.481416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2348  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.41 
 
 
451 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1504  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.65 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272495  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4168  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.73 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2788  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.53 
 
 
461 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2934  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.53 
 
 
461 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3606  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.4 
 
 
453 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2079  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.24 
 
 
462 aa  43.5  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10391  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.07 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18871  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.88 
 
 
470 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1370  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.28 
 
 
455 aa  43.5  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.329837  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0615  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  35.35 
 
 
476 aa  43.1  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0421  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.95 
 
 
457 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.34 
 
 
230 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>