65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10013 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  809    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  68.21 
 
 
391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  49.75 
 
 
391 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  48.08 
 
 
389 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  48.86 
 
 
409 aa  365  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  49.62 
 
 
397 aa  358  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  46.61 
 
 
389 aa  356  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  48.08 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  34.34 
 
 
415 aa  216  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  34.5 
 
 
420 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  33.25 
 
 
417 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  32.32 
 
 
457 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  32.58 
 
 
418 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  32 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  41.47 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  32.58 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  39.76 
 
 
417 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  29.47 
 
 
415 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  30.79 
 
 
431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  28.98 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  26.15 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  33.8 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.18 
 
 
224 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.66 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  31.21 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  30.07 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.37 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  30.77 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  27.85 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  28.48 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  32.12 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25.12 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  26.17 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.37 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  34.51 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  29.17 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
401 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  31.78 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  29.17 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.85 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  26.03 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  24.87 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  28.17 
 
 
212 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.94 
 
 
411 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  25 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  28.17 
 
 
218 aa  52.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  26.47 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  26.95 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  23.23 
 
 
236 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  28.47 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
414 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  39.06 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.34 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  39.06 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1546  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.26 
 
 
489 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.67 
 
 
393 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>