61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2392 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  847    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  68.99 
 
 		 415 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  63.16 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  59.57 
 
 		 418 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  57.25 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  54.96 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  50.6 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  39.02 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  33.01 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  32.19 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  31.15 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  41.47 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  31.37 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  32.18 
 
 		 457 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  32.57 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  29.34 
 
 		 409 aa  183  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  28.84 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  31.31 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  31.16 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  29.47 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  35.37 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  32.32 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  33.14 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  33.97 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  29.48 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  27.4 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  27.46 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.36 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  25.71 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  28 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  23.66 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  29.84 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  30.53 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  25.76 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  26.11 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  22.76 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  23.53 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.34 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  24.27 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  24.15 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  24.11 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  24.75 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  26.42 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.44 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  26.83 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  31.29 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.63 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  21.58 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.59 
 
 		 224 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  25.17 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.29 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  25.98 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.7 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488351  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0981  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.69 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2933  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.31 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.277455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5504  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0333  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>