93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3271 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  100 
 
 
397 aa  830    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  58.88 
 
 
398 aa  491  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 
389 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  48.09 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  49.62 
 
 
390 aa  358  7e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  45.09 
 
 
409 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  43.77 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  41.75 
 
 
389 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  38.76 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  35.27 
 
 
418 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  34.95 
 
 
418 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  33.9 
 
 
417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  32.45 
 
 
417 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  33.09 
 
 
415 aa  209  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  34.19 
 
 
457 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  31.37 
 
 
416 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  33.1 
 
 
457 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  30.75 
 
 
415 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  31.43 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  31.63 
 
 
431 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.23 
 
 
397 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  25.15 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  37.23 
 
 
396 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  35.95 
 
 
403 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  37.59 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.42 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  35.97 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.33 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.19 
 
 
224 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  32.64 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.83 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.47 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  29.52 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  29.52 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  30.97 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  34.59 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  29.71 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  29.94 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.94 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.3 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  32.09 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  29.41 
 
 
230 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.89 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  31.08 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.26 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  24.39 
 
 
236 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.89 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  25.19 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  29.34 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.82 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  31.37 
 
 
218 aa  54.7  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  29.88 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.26 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  24.28 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  28.17 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.56 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73220  glucosamine-1-phosphate acetyltransferase/N-acetyl  26.45 
 
 
454 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6354  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.45 
 
 
454 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0229  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  27.19 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.976567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0560  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.36 
 
 
471 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3644  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.81 
 
 
454 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.63 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0220  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.51 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600609  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0583  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.14 
 
 
454 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0233348  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0548  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.14 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0186  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.52 
 
 
454 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.28 
 
 
269 aa  46.6  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3194  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.49 
 
 
483 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2742  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  27.54 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.19388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0288  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.9 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.38 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13380  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  22.48 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0007  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.5 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1293  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.31 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0894  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.27 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3072  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.45 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.9 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3729  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.38 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625881  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  24.73 
 
 
388 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2323  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.2 
 
 
462 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.845918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2709  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.37 
 
 
516 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3204  fused N-acetyl glucosamine-1-phosphate uridyltransferase and glucosamine-1-phosphate acetyl transferase  31.48 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0207  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  27.38 
 
 
467 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.64 
 
 
460 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2585  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.07 
 
 
463 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  35.42 
 
 
381 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>