68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2049 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  863    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  57.04 
 
 
418 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  54.96 
 
 
416 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  53.19 
 
 
417 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  52.78 
 
 
415 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  53.4 
 
 
418 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  51.72 
 
 
415 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  39.26 
 
 
420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  36.34 
 
 
398 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  33.9 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  31.13 
 
 
391 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  32.84 
 
 
409 aa  206  8e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  33.25 
 
 
390 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  31.78 
 
 
457 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  29.88 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  29.5 
 
 
389 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  31.42 
 
 
391 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  31.32 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  30.73 
 
 
413 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  29.52 
 
 
431 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.54 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  28 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  31.55 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  33.57 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  31.43 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  32.97 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  27.07 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  30.23 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  31.11 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.89 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  27.61 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  25 
 
 
218 aa  65.5  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  29.89 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.9 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  28.71 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.88 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 
403 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.55 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.43 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  25.13 
 
 
224 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.34 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 
404 aa  60.1  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 
401 aa  60.1  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  26.62 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  29.79 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  25.29 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  29.53 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.71 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.01 
 
 
230 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.99 
 
 
269 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  25.76 
 
 
236 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  28.97 
 
 
209 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0333  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.71 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  30.63 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0384  putative acyltransferase  23.39 
 
 
146 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0424  putative acyltransferase  23.39 
 
 
146 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3266  putative transferase  23.39 
 
 
146 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482396  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0390  putative acyltransferase  23.39 
 
 
146 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.141633  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  36.47 
 
 
214 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.29 
 
 
483 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.36 
 
 
460 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4068  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.69 
 
 
488 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>