75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0299 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  68.99 
 
 		 416 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  61.96 
 
 		 418 aa  534  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  61.27 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  57.32 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  52.78 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  51.95 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  36.41 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  34.34 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  33.09 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  33.17 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  33.25 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 		 389 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  32.45 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  33.72 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  32.64 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  33.73 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  34.05 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  30.38 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  30.97 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  31.55 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  27.73 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  31.55 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  30.95 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  27.98 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.93 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  27.98 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  25.21 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.44 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  31.84 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  28.25 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.43 
 
 		 403 aa  67  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  30.39 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  26.53 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.48 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  25.91 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.37 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  30.83 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  27.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  28.16 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  23.76 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25.96 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  24.84 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.96 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  21.78 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.4 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  24.44 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0288  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.89 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  33.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  30.84 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  21.95 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0557  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.21 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  22.29 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.06 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4168  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8608  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.37 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4525  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.54 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0333  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.12 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0657  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.1 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.22 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488351  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4156  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.54 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  27.2 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.8 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5504  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.21 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1909  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.84 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.19 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.19 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1725  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.27 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1454  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.47 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>