74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1567 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  811    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  52.45 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  49.75 
 
 
390 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  43.44 
 
 
398 aa  333  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  43.77 
 
 
397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  46.07 
 
 
389 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  40.71 
 
 
389 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  39.54 
 
 
409 aa  288  8e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  32.54 
 
 
420 aa  202  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  32.45 
 
 
415 aa  202  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  31.15 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  32.84 
 
 
418 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  31.1 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  29.51 
 
 
457 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  30.34 
 
 
418 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  31.42 
 
 
417 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  31.58 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  29.34 
 
 
457 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  29.83 
 
 
413 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  27.32 
 
 
431 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  34.9 
 
 
402 aa  86.3  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  27.46 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.04 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.51 
 
 
224 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  27.41 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.43 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.72 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  27.11 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.03 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  25.71 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  26.79 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  23.23 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.17 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  28.28 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  27.03 
 
 
334 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  24.75 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  28.68 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  29.93 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  24.22 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  24.88 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  25.37 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  27.14 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  26.67 
 
 
230 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  26.99 
 
 
411 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  22.09 
 
 
209 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.77 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  27.46 
 
 
218 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.74 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.77 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0288  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.86 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4487  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.32 
 
 
459 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.25 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  26.17 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.87 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  25.38 
 
 
411 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
381 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0229  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.06 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.976567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  28.67 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  27.1 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  25.36 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0560  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.67 
 
 
471 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1947  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26 
 
 
505 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1707  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.37 
 
 
496 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0618  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.26 
 
 
446 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176801  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.35 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>