More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6841 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.183827 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.06 
 
 
241 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.83 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682168  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.83 
 
 
241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.32 
 
 
237 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.16 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
235 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4885  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 
235 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155643  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0302  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
236 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186456  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5126  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 
236 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
236 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 
235 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.19 
 
 
236 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.19 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330644  normal  0.646383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
246 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281414  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
236 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235673  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
236 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  44.31 
 
 
243 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3225  bacilysin biosynthesis oxidoreductase BacC  44.86 
 
 
242 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
236 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.823656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
247 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
248 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8438  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 
236 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206698  normal  0.50217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
244 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.977766  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
244 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626733  normal  0.253561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  43.98 
 
 
244 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
244 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
260 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
262 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
248 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
263 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
262 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
256 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.45 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
254 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
257 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
262 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
267 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.239754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  31.35 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.42 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2737  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.71 
 
 
249 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.3 
 
 
250 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
269 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
253 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.75 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  33.2 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
262 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
263 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
263 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  33.47 
 
 
263 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  31.91 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
266 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
263 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
253 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
275 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  30.56 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  30.47 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  30.56 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  30.56 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>