58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6164 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 425 aa  861    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  68.96 
 
 		 430 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  64.68 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  65.43 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  64.04 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  64.02 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  63.36 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  60.71 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  61.88 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  59.19 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  53.07 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  53.22 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  51.28 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  51.98 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  51.29 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  52.39 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  53.32 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  49.07 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  50.47 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  52.22 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  49.06 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  48.5 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  49.65 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  47.14 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  44.79 
 
 		 449 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  44.95 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  44.5 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  45.22 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  45.06 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  45.19 
 
 		 403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  43.6 
 
 		 397 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  44.17 
 
 		 397 aa  323  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  45.1 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  41.34 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  40.3 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  40.29 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  42.36 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  38.37 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  38.18 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  37.74 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  30.08 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  32.16 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  28.04 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  30.67 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  26.22 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  28.18 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  27.84 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  27.44 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  26.18 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  27.45 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  26.33 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  26.58 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  24.94 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  28.61 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  27.27 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  27.44 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  30 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  27.64 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>