58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5195 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  95.39 
 
 
434 aa  821    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  83.33 
 
 
434 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  100 
 
 
434 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  64.91 
 
 
434 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  65.19 
 
 
430 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  62.99 
 
 
435 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  63.13 
 
 
425 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  58.47 
 
 
404 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  58.7 
 
 
404 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  55.99 
 
 
402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  52.9 
 
 
414 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  52.93 
 
 
404 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  53.12 
 
 
404 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  54.1 
 
 
404 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  52.42 
 
 
409 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  51.04 
 
 
404 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  50.23 
 
 
402 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  50.12 
 
 
410 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  49.88 
 
 
410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  49.66 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  50 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  50.35 
 
 
404 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  48.96 
 
 
401 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  47.88 
 
 
423 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  45.9 
 
 
449 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  45.18 
 
 
436 aa  356  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  44.42 
 
 
441 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  45.15 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  42.18 
 
 
425 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  41.23 
 
 
403 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  43.47 
 
 
397 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  43.47 
 
 
397 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  44.47 
 
 
541 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  38.97 
 
 
405 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  40.1 
 
 
409 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  38.44 
 
 
407 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  41.61 
 
 
433 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  38 
 
 
403 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  36.53 
 
 
411 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  36.45 
 
 
403 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  30.77 
 
 
426 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  27.48 
 
 
463 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  31.36 
 
 
451 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  29.77 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  27.1 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  26.53 
 
 
427 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  26.06 
 
 
510 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  28.83 
 
 
376 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  27.27 
 
 
453 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  25.46 
 
 
397 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  26.87 
 
 
420 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  27 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  28.02 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  27.1 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  29.01 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  27.57 
 
 
420 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  30.19 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  30.65 
 
 
365 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>