57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4673 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 407 aa  828    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  74.38 
 
 		 409 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  45.33 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  41.79 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  43.49 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  44.27 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  42.49 
 
 		 401 aa  292  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  44.19 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  44.19 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  39.85 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  40.65 
 
 		 430 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  38.96 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  37.86 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  38.5 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  39.9 
 
 		 404 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  39.04 
 
 		 410 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  38.99 
 
 		 410 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  38.31 
 
 		 410 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  39.12 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  40.3 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  38.44 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  41.49 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  41.18 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  36.65 
 
 		 414 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  37.2 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  38.06 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  41.71 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  36.24 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  36.32 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  36.02 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  36.66 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  35.62 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  37.7 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  35.34 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  33.6 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  32.54 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  38.42 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  35.36 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  33.42 
 
 		 403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  32.47 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  27.3 
 
 		 426 aa  99.4  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  24.41 
 
 		 453 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  24.46 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  24.94 
 
 		 463 aa  86.3  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  24.37 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  25.94 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  23.16 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  24.27 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  28.18 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  23.51 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  25.07 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  31.82 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  21.79 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  23.25 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  22.37 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  22.73 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  24.68 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>