58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5465 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  83.33 
 
 		 434 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 434 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  83.33 
 
 		 434 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  62.16 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  64.34 
 
 		 430 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  61.17 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  64.02 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  58.76 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  58.76 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  55.5 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  52.53 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  52.3 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  54.02 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  52.76 
 
 		 404 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  53 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  50 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  50 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  50.12 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  50.8 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  50.35 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  50.35 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  51.75 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  49.08 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  47.42 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  45.75 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  44.16 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  45.73 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  45.14 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  42.52 
 
 		 425 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  43.94 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  43.94 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  40.9 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  44.09 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  41.37 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  39.85 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  38.23 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  41.11 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  38.76 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  36.64 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  35.65 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  29.76 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  30.11 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  27.63 
 
 		 463 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  26.35 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  29.64 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  25.79 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  26.71 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  27.65 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  26.76 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  27.4 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  27.87 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  26.22 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  26.98 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  31.43 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  27.55 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  26.78 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  27.44 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  29.71 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>