53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5911 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  100 
 
 		 376 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  59.84 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  30.3 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  32.09 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  29.32 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  27.04 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  27.41 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  31.49 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  27.55 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  31.2 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  28.61 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  32.01 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  29.92 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  27.01 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  27.55 
 
 		 414 aa  99.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  27.9 
 
 		 404 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  27.57 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  27.2 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  29.63 
 
 		 541 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  28.77 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  31.02 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  32.01 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  27.29 
 
 		 434 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  29.14 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  27.79 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  29.1 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  27.42 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  28.69 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  26.13 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  26.39 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  25.42 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  26.01 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  25.2 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  26.22 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  26.2 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  25.13 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  37.72 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  26.29 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  26.29 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  26.56 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  25.07 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  35.2 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  24.47 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  24.06 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  35.29 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  40.54 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  26.21 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  35.71 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  25.25 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  25.07 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  25.07 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  47.83 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  35.71 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>