57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4709 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 404 aa  824    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  67.34 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  64 
 
 		 402 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  51.9 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  53.92 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  53.9 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  51.07 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  53.73 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  51.75 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  50.35 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  51.42 
 
 		 430 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  53.37 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  50.12 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  49.64 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  51.63 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  49.65 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  49.62 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  49.51 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  49.87 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  50.13 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  50.13 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  48.13 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  49.5 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  48.13 
 
 		 404 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  49.1 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  46.84 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  45.11 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  44.95 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  46.27 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  45.21 
 
 		 409 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  45.33 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  43.08 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  44.13 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  43.85 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  47.43 
 
 		 541 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  41.71 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  39.3 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  41.13 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  37.38 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  35.02 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  28.89 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  29.77 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  28.92 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  27.04 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  25.18 
 
 		 510 aa  99.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  24.88 
 
 		 463 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  28.72 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  25.48 
 
 		 453 aa  90.1  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  24.01 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  23.99 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  28.4 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  21.97 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  26.42 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  30.56 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  27.33 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  25 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  25.27 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>