48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7390 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_7390  transposase  100 
 
 		 405 aa  816    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  85.19 
 
 		 420 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  47 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  26.17 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  28.13 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  23.86 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  26.78 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  28.07 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  26.05 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  25.74 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  26.25 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  23.98 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  26.65 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  26.01 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  26.88 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  26.42 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  25.19 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  24.81 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  24.79 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  26.37 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  24.55 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  24.42 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  28.4 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  24.18 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  27.44 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  23.5 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  24.35 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  26.84 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  22.39 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  26.39 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  24.56 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  25.12 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  31.18 
 
 		 541 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  24 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  26.05 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  23.92 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  23.92 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  24.29 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  25.42 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  31.82 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  23.01 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  22.73 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  26.08 
 
 		 463 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  22.65 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  24.01 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  22.86 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  32.5 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  34.94 
 
 		 437 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>