58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5557 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  88.51 
 
 		 435 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 434 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  69.11 
 
 		 430 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  64.2 
 
 		 434 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  63.05 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  64.68 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  62.16 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  61.52 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  61.98 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  59.86 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  54.61 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  51.61 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  52.07 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  51.61 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  51.38 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  52.07 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  51.05 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  49.66 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  50 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  51.49 
 
 		 402 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  48.75 
 
 		 410 aa  411  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  51.07 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  49.54 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  46.71 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  44.83 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  45.52 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  44.63 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  45.63 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  43.22 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  42.89 
 
 		 425 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  44.89 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  44.66 
 
 		 397 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  45.09 
 
 		 541 aa  299  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  39.27 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  38.96 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  38.17 
 
 		 405 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  43.13 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  39.4 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  38.07 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  40.1 
 
 		 403 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  31.48 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  30.95 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  32.38 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  28.13 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  28.11 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  27.99 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  26.32 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  28.08 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  28.01 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  28.34 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  26.13 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  25.55 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  25.12 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  52.17 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  29.5 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  24.81 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  25.97 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  39.76 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>