58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4573 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 441 aa  902    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  75.38 
 
 		 425 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  69.06 
 
 		 436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  63.57 
 
 		 449 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  63.09 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  50.61 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  50.36 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  50 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  48.37 
 
 		 401 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  46.82 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  46.56 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  46.84 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  46.41 
 
 		 404 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  44.42 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  48.39 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  45.5 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  43.72 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  45.14 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  44.7 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  45.55 
 
 		 404 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  43.72 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  44.18 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  43.22 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  43.53 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  45.22 
 
 		 425 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  44.8 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  42.06 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  44.53 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  43.8 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  43 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  48.09 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  41.37 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  41.37 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  39.05 
 
 		 405 aa  266  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  37.41 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  39.14 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  38.19 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  37.35 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  35.34 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  35.08 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  28.54 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  28.88 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  27.99 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  27.94 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  31.2 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  29.59 
 
 		 381 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  26.23 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  27.85 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  28.05 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  27.46 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  24.34 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  23.58 
 
 		 427 aa  86.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  27.33 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  24.88 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  27.2 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  23.86 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  24.4 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  27.82 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>