58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0001 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  100 
 
 		 397 aa  814    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  99.5 
 
 		 397 aa  809    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  68.56 
 
 		 393 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  51.86 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  52.17 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  50.13 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  49.1 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  45.22 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  46.56 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  48.22 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  45.41 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  44.89 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  44.42 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  43.7 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  43.6 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  43.94 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  44.96 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  43.6 
 
 		 425 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  43.47 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  43.71 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  43.11 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  43.12 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  42.78 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  41.52 
 
 		 449 aa  311  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  42.97 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  41.37 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  40.62 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  40.94 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  42.6 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  44.19 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  38.22 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  41.65 
 
 		 404 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  40.66 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  43.5 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  40.92 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  42.7 
 
 		 541 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  36.59 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  36.64 
 
 		 433 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  34.9 
 
 		 411 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  36 
 
 		 403 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  28.86 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  29.58 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  28.88 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  24.16 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  26.02 
 
 		 451 aa  96.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  26.63 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  23.29 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  25 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  24.94 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  27.02 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  23.82 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  27.84 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  26.57 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  21.5 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  22.82 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  29.33 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  23.39 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  23.41 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>