55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4352 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  100 
 
 		 510 aa  1031    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  30.02 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  29.59 
 
 		 420 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  28.05 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  27.89 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  28.13 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  28.83 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  27.74 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  28.57 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  26.85 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  26.1 
 
 		 434 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  28.09 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  26.64 
 
 		 425 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  25.84 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  25.48 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  25.18 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  26.05 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  26.03 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  26.48 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  25.84 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  26.43 
 
 		 436 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  24.94 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  28.24 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  25.73 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  26.98 
 
 		 410 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  25.19 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  25.86 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  25.92 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  24.7 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  25.62 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  25.79 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  27.03 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  25.29 
 
 		 402 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  26.14 
 
 		 449 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  25.59 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  27.78 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  27.08 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  25.33 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  25.43 
 
 		 403 aa  92.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  25.59 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  23.6 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  26.68 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  23.15 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  25.51 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  25.64 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  25.95 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  26.15 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  25.13 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  23.6 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  35.29 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  36.21 
 
 		 381 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  32.89 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  24.01 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  36.27 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  36.11 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>