58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3518 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  100 
 
 		 453 aa  907    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  54.34 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  54.59 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  55.04 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  40.28 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  31.91 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  31.98 
 
 		 413 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  28.34 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  27.53 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  30.23 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  28.71 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  30.17 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  30.14 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  28.03 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  28.5 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  26.85 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  26.56 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  27.48 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  27.9 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  30.82 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  27.45 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  27.53 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  27.92 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  24.53 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  28.05 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  27.82 
 
 		 434 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  28.54 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  26.11 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  27.4 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  27.84 
 
 		 510 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  24.54 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  26.15 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  31.56 
 
 		 541 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  25.76 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  27.12 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  25.2 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  32.99 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  24.94 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  27.38 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  25.43 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  24.77 
 
 		 404 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  23.57 
 
 		 393 aa  86.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  29.06 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  33.33 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  24.43 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  26.85 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  24.94 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  24.69 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  27.59 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  28.82 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  35.76 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  24.88 
 
 		 404 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  32.37 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  34.45 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  28.3 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  26.86 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  36.04 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  23.81 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>