58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3578 on replicon NC_009470
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  100 
 
 		 451 aa  904    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  58 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  51.61 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  55.04 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  42.13 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  32.15 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  30.02 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  32.08 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  30.16 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  29.64 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  28.44 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  30.11 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  30.83 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  31.23 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  28.44 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  29.49 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  29.91 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  29.17 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  28.57 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  28.76 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  27.97 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  28.87 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  26.94 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  28.46 
 
 		 404 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  29.53 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  28 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  28.75 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  29.2 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  28.44 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  26.48 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  28.97 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  30.77 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  30.08 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  27.02 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  28.02 
 
 		 404 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  28.97 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  27.87 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  31.48 
 
 		 541 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  29.15 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  28.57 
 
 		 411 aa  96.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  27.17 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  25.12 
 
 		 393 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  25.13 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  25.56 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  28.61 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  26.44 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  26.44 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  24.31 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  25.64 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  29.53 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  26.04 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  26.63 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  25.06 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  27.62 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  28.26 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  36.19 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  26.89 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  24 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>