59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5588 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  98.13 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  77.45 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  65.69 
 
 		 104 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  52.94 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  52.94 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  45 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  45 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  46 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  50.98 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  44 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  40.38 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  44.66 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  43 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  45.83 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  45.83 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  41 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  42.31 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  43.69 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  37.25 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  40.2 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  40.2 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  47.17 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  43.27 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  43.27 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  35.29 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  36.08 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  32.32 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  33.7 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  33.7 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  31.18 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  31.18 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  31.58 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  30.77 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  29.52 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  26.73 
 
 		 388 aa  50.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 317 aa  50.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  28.57 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  36.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  36.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  27.08 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  26.37 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  37.84 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  33.03 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  35.92 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  23.81 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  34.31 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  30.48 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  25.71 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  27.62 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  28.71 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  27 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  37.33 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  37.33 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  31.58 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>