17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2700 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  48.31 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  45.37 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  42.29 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  40.8 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  36.14 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  39.51 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  38.73 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  39.13 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  41.28 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  41.28 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  29.21 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  39.42 
 
 		 104 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  39.19 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  37.84 
 
 		 107 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  33.01 
 
 		 108 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  37.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>