49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1039 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  42 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  36.89 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  40.2 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  40.2 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  40.2 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  41.18 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  36.54 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  38 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  42.57 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  44.68 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  45.19 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  42.55 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  42.31 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  39.81 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  35 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  42.22 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  38.24 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  35.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  36.27 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  34.31 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  40.78 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  31.73 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  35.64 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  32.63 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  32.63 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  30.1 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  38.68 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  34.26 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  31.43 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  31.48 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  28.72 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  36.45 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  36.45 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  31.48 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  31.48 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  31.82 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  32.73 
 
 		 268 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  30.56 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  31.51 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  29.63 
 
 		 108 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>