37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2711 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  76.19 
 
 		 120 aa  176  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  76.47 
 
 		 115 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  65.05 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  65.05 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  65.05 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  63.73 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  55.24 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  40 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  35.11 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  35.11 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  33.65 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  31.68 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  30.53 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  30.53 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  32.63 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  33.98 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  30.1 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  32.98 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  32.98 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  32.61 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  31.58 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  29.47 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  30.77 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  30.84 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  27.66 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  32.93 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  32.26 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  31.68 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  28.28 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  40 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  40 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  29.17 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  32.76 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  26.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>