37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2725 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  62.96 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  68.63 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  61.32 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  61.9 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  57.84 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  63.73 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  61.54 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  57.73 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  44.68 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  40.21 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  37.89 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  32.98 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  32.98 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  31 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  37.25 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  31.37 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  37.23 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  33.68 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  38.68 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  32.98 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  31.18 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  31.18 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  37.25 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  31.91 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  30.85 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  36.17 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  29.47 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  43.86 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  43.86 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  31.91 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  35.9 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>