41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0041 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 128 aa  265  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  49.07 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  54.81 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  54.81 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  52.48 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  52 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  47.12 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  47 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  42 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  44 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  43 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  49 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  47 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  44.33 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  44.21 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  44.21 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  45 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  39.18 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  36.19 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  38 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  38 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  46 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  45.1 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  36.63 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  34.34 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  42.16 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  42.16 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  34.04 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  32.32 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  32.99 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  32.99 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  32.98 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  35.35 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  36.84 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  32.98 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  32.32 
 
 		 388 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  28.42 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 317 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  26.92 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  25.96 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>