38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3611 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  37.11 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  39.8 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  36.63 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  41 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  39.39 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  37.11 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  35.42 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  36.73 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  36.08 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  36.84 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  36.84 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  43.88 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  39.53 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  37.8 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  37.63 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  34.69 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  38.68 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  31.91 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  29.41 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  33.68 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  37.37 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  28.43 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  37.37 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  43 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  29.59 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  30.84 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  30.3 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  33.33 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  36.36 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  30.95 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  36.36 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  28.42 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  25.26 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>