40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2134 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  52.48 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  52.48 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  53.4 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  60.19 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  47.12 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  42.72 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  44.34 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  47.12 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  48.96 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  48.96 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  43.69 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  43.69 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  48.54 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  50.49 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  42.57 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  43.27 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  42.72 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  38.38 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  41 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  37.37 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  41 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  39.81 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  39.6 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  36.73 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  38.46 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  35.71 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  36.84 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  31.43 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  38.24 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  35.24 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  32.93 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  34.15 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  31.33 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  28.97 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  28.57 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>