21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03240 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  39.45 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  26.55 
 
 
203 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  24.66 
 
 
203 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  32.35 
 
 
104 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  31.37 
 
 
118 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  31.07 
 
 
108 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  29.7 
 
 
106 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  24.26 
 
 
197 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  24.18 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  25.13 
 
 
208 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  29.13 
 
 
107 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  28.16 
 
 
107 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  24.74 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  24.06 
 
 
204 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  28.12 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  27.72 
 
 
110 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  31.08 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  22.46 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  22.99 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  22.99 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>