48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3143 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 113 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  54.81 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  46.15 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  51.49 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  52.48 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  49 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  45 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  45 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  44 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  47 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  47.37 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  47.37 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  42 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  46 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  42.27 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  44 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  38.14 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  39.36 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  38.95 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  38.95 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  41 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  42.16 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  33.04 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  35 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  35.64 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  40.2 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  40.2 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  35.11 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  32.98 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  32.69 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  30.53 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  29.79 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  30.77 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  25.96 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  29.29 
 
 		 214 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  27.88 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  27.88 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  29.46 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  26.32 
 
 		 388 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  27.88 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  27.88 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  26.92 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  29.69 
 
 		 270 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>