43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2693 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  65.35 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  57.84 
 
 		 111 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  56.07 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  60.78 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  59.8 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  58.1 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  55.24 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  51.02 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  40 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  42.55 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  35.16 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  33.04 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  33.04 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  36.17 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  36.17 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  39.6 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  40 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  35.35 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  34.04 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  35.11 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  35.79 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  31.18 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  30.11 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  29.59 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  29.03 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  40.79 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  23.3 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  35.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  36.17 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  42.11 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  42.11 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  36 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  38.3 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  27.84 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  25.47 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  28.95 
 
 		 108 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  25.47 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  27.63 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  27.71 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  24.53 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  23.58 
 
 		 108 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>