37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5493 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  239  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  79.59 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  76.47 
 
 		 116 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  59.6 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  58 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  56.57 
 
 		 108 aa  121  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  56.57 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  57.73 
 
 		 111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  51.02 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  36.84 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  31.19 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  32.29 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  36.84 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  31.58 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  29.79 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  29.79 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  29.79 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  34.15 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  28.72 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  31.18 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  25.53 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  27.27 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  27.27 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  32.26 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  28.57 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  28.57 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  25.53 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  26.37 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  33.78 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  27.37 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  33.78 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  28.87 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  29.27 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  29.31 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  25.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  25.27 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  26.53 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>