47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0586 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  100 
 
 
106 aa  220  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  43.88 
 
 
112 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  46 
 
 
128 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  45.1 
 
 
110 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  43 
 
 
113 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  42.16 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  44.34 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  42 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  41.41 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  41.41 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  42 
 
 
113 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  41.41 
 
 
107 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  38.24 
 
 
108 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  42.72 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  41.18 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  37.25 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  37.25 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  40.4 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  46.08 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  40 
 
 
118 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  40 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  43.14 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  37.89 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  38.24 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  36.84 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  44.12 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  39.42 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  34.65 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  40.38 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  40.38 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  31.37 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  34.95 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  34.69 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
317 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  31.96 
 
 
388 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  28.57 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  27.62 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  27.62 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  26.67 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  27.62 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2174  hypothetical protein  26.8 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  25.71 
 
 
108 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  27.27 
 
 
203 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>