43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2268 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  100 
 
 		 108 aa  223  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  52.48 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  51.49 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  51.49 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  49.04 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  46.6 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  45.63 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  42.57 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  44.66 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  40.38 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  47.12 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  47.92 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  47.92 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  42.72 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  44.66 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  42.31 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  45.71 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  39.6 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  43.27 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  39.05 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  36.73 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  35.58 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  42.45 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  37.23 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  34.95 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  32.04 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  42.73 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  42.73 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  32.99 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  32.99 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  35.79 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  32.69 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  31.58 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  29.47 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  30.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  34.78 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  28.3 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  33.01 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  27.37 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  30.84 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  31.68 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  30.63 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>