18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2157 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  61.58 
 
 
204 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  60.1 
 
 
204 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  59.11 
 
 
204 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  57.64 
 
 
204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  57.64 
 
 
204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  45.93 
 
 
208 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  45.37 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  42.36 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  40.2 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  35.79 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  31.58 
 
 
197 aa  92  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 
317 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  22.35 
 
 
388 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  35.92 
 
 
107 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  35.92 
 
 
107 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  30.84 
 
 
108 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  36.49 
 
 
108 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.441941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>