16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2959 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  29.21 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  27.78 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  27.37 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  31.58 
 
 
204 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  30.92 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  31.76 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  30 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  26.19 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  25.13 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  25.33 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
317 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  29.89 
 
 
388 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  31.68 
 
 
108 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  27 
 
 
107 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>