18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6103 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  52.22 
 
 		 203 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  47.83 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  42.36 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  42.29 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  47.37 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  47.37 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  42.08 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  40.39 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  39.41 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  35.12 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  27.78 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  35.58 
 
 		 104 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  26.96 
 
 		 388 aa  45.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  30.69 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  29.7 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  28.71 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>